行政机关应当依法注销行政许可的情形是根据《行政许可法》第七十条规定，有下列情形之一的，行政机关应当依法办理有关行政许可的注销手续：
（一）行政许可有效期届满未延续的；
（二）赋予公民特定资格的行政许可，该公民死亡或者丧失行为能力的；
（三）法人或者其他组织依法终止的；
（四）行政许可依法被撤销、撤回，或者行政许可证件依法被吊销的；
（五）因不可抗力导致行政许可事项无法实施的；
（六）法律、法规规定的应当注销行政许可的其他情形。
注销释义：取消登记在册的事项； 取消记录在案的事项。
详细解释编辑 播报
1. 《初刻拍案惊奇》卷二：“ 李知县 升堂，正待把 潘甲 这宗文卷注销立案。”《二十年目睹之怪现状》第四六回：“_他_要制台照数还了他，注销了这个县丞，不做官了。” 萧乾 《美国点滴》：“还者只消把书放进大厅里一个洞口，借书的记录就自会注销了。”
2. 明 张居正 《请稽查章奏随事考成以修实政疏》：“凡各衙门题奏过本状，俱附写文簿。后五日，各衙门具发落日期，赴科注销。过期稽缓者，参奏。” 郑观应 《危言·禁烟上》：“其有秀才、举人、进士词林及现任官已吸烟者，限三年戒清，由族长或同乡官具禀地方官注销烟籍之名。”一本作“ 注销 ”。
法律依据：
《行政许可法》第七十条
有下列情形之一的，行政机关应当依法办理有关行政许可的注销手续：
（一）行政许可有效期届满未延续的；
（二）赋予公民特定资格的行政许可，该公民死亡或者丧失行为能力的；
（三）法人或者其他组织依法终止的；
（四）行政许可依法被撤销、撤回，或者行政许可证件依法被吊销的；
（五）因不可抗力导致行政许可事项无法实施的；
（六）法律、法规规定的应当注销行政许可的其他情形。